유전자 분석 - sequencing을 이용한 ADH와 ALDH2의 유전자형 분석과 polymorphism 발굴
유전자 분석 - sequencing을 이용한 ADH와 ALDH2의 유전자형 분석과 polymorphism 발굴
Abstract
이번 실험은 사람의 DNA에서 특정 유전자(ADH, ALDH2)에 대하여 유전적 기능을 특징짓는 SNP를 RFLP를 통해 확인하고 sequencing을 통해 정확한 sequence를 찾아내어 여러 sample DNA들을 Data base의 reference와 비교 분석해보는 실험이었다. 먼저 18개의 준비된 sample DNA들은 RFLP를 이용해 ALDH2 유전자가 들어있는 DNA 부분에 대해 제한효소(MboⅡ)를 반응시켜줘 제한효소가 반응하는 site에 존재하는 SNP를 확인했다. 준비된 DNA는 그 양이 많지 않기 때문에 primer를 만들어줘 필요한 부분(ALDH2가 들어있는 약 135bp size로 만들 수 있는)이 들어가게 해주고 tochdown PCR을 실행한다. 그 후, 제한효소와 하룻밤동안 충분히 반응시켜준 뒤, 4% agarose gel에 전기영동시켜주면 3가지 형태의 band가 나오게 된다[Fig 2.]. 여기서 큰 size의 band만 뜬 것은 ALDH2(Lys/Lys)을 뜻하는 것으로 제한효소에 의해 잘리지 않았다는 것을 의미하며 작은 size의 band만 뜬 것은 ALDH2(Glu/Glu)를 의미하는데, 이것은 두 DNA가닥이 모두 제한효소에 의해 잘렸기 때문인 것이다. 마지막으로 두 band 모두 나타나는 것은 heterotype으로서 ALDH2(Glu/Lys)을 의미하게 된다. 여기서는 Glu를 포함한 DNA만 잘리기 때문에 두개의 Band가 차례로 뜨게 되는 것이다. 그리고 sequencing을 DNA 분석에서는 sequencing의 세부과정은 업체를 통해 진행하였고 sequence 결과에 대한 분석을 실시한 결과 ADH에 대한 SNP[Fig 3.]를 확인할 수 있었고 ALDH2에 대한 SNP[Fig 6.]역시 확인할 수 있었다.
ntroduction
....
이번 실험은 사람의 DNA에서 특정 유전자(ADH, ALDH2)에 대하여 유전적 기능을 특징짓는 SNP를 RFLP를 통해 확인하고 sequencing을 통해 정확한 sequence를 찾아내어 여러 sample DNA들을 Data base의 reference와 비교 분석해보는 실험이었다. 먼저 18개의 준비된 sample DNA들은 RFLP를 이용해 ALDH2 유전자가 들어있는 DNA 부분에 대해 제한효소(MboⅡ)를 반응시켜줘 제한효소가 반응하는 site에 존재하는 SNP를 확인했다. 준비된 DNA는 그 양이 많지 않기 때문에 primer를 만들어줘 필요한 부분(ALDH2가 들어있는 약 135bp size로 만들 수 있는)이 들어가게 해주고 tochdown PCR을 실행한다. 그 후, 제한효소와 하룻밤동안 충분히 반응시켜준 뒤, 4% agarose gel에 전기영동시켜주면 3가지 형태의 band가 나오게 된다[Fig 2.]. 여기서 큰 size의 band만 뜬 것은 ALDH2(Lys/Lys)을 뜻하는 것으로 제한효소에 의해 잘리지 않았다는 것을 의미하며 작은 size의 band만 뜬 것은 ALDH2(Glu/Glu)를 의미하는데, 이것은 두 DNA가닥이 모두 제한효소에 의해 잘렸기 때문인 것이다. 마지막으로 두 band 모두 나타나는 것은 heterotype으로서 ALDH2(Glu/Lys)을 의미하게 된다. 여기서는 Glu를 포함한 DNA만 잘리기 때문에 두개의 Band가 차례로 뜨게 되는 것이다. 그리고 sequencing을 DNA 분석에서는 sequencing의 세부과정은 업체를 통해 진행하였고 sequence 결과에 대한 분석을 실시한 결과 ADH에 대한 SNP[Fig 3.]를 확인할 수 있었고 ALDH2에 대한 SNP[Fig 6.]역시 확인할 수 있었다.
ntroduction
....
-
생물학 - Bioinformatics Sequencing 보고서
Bioinformatics Sequencing 1. 실험 제목 Bioinformatics Sequencing 2. 실험목적 sequencing에 대해 이해하고, sequencing을 통해 알 수 있는 DNA 염기서열을 가지고 BLAST 분석을 통하여 gene의 ORF, homolog.. -
[분자생물학] DNA 염기서열 분석방법
분자생물학자들이 수행하는 가장 중요한 기술은 DNA 조각을 정확히 염기 배열하는 DNA 염기서열 결정법일 것이다. DNA 염기서열 결정법은 30여 년간 발전 및 이용되어왔으나, 1970년대 후반에 들어서야 빠르고 효.. -
pcr과 형질전환
PCR Polymerase chain reaction(PCR) technique은 1980년대 중반 K. Mullis에 의해서 고안된 기술이다. 이 PCR techinique은 유전자를 연구, 분석하는 분자유전학에 혁신을 일으켰다. 유전자를 분석하고 연구하는.. -
일반생물학 실험 - Polymerase chain reaction(PCR)
Polymerase chain reaction(PCR) technique은 1980년대 중반 K. Mullis에 의해서 고안된 기술이다. 이 PCR techinique은 유전자를 연구, 분석하는 분자유전학에 혁신을 일으켰다. 유전자를 분석하고 연구하는데 있.. -
실험 12주차_PTC에 의한 미맹검사 결과 Report
실험 제목 : PTC에 의한 미맹검사 PTC 미맹 이 중 유전자형이 TT, Tt인 사람은 PTC용액의 쓴맛을 느낄 수 있으나, 유전자형이tt인 사람은 PTC용액의 쓴맛을 느낄 수 없는 PTC 미맹이 된다. 그러나 본 연구 결과, P.. -
생물화학공학-유전체학, 프로테오믹스에 대해
Genomics, Proteomics 유전체학 [ genomics, 誘電體學 ] - 생물의 디옥시리보 핵산(DNA), 리보 핵산(RNA)과 같은 유전 정보를 밝히고자 유전체(genome)를 단위로 실험 구상과 정보 처리를 수행하는 학문. 유전체.. -
지바이오테크놀로지 - 유전자 전이의 원리
유전자 전이의 원리 목차 유전자 전이 DNA와 RNA의 구조 DNA와 RNA의 차이점 DNA의 복제 RNA의 전사 단백질 합성 1. 유전자의 전이 부모를 닮은 새로운 개체를 번식 멘델의 유전 법칙 분리,독립,우열 의 법칙 염.. -
진단분자 생물학 - 유전적 분자형에 따라 혈액형을 구분하는 실험[Molecular Genotyping of the ABO Blood Types]
Molecular Genotyping of the ABO Blood Types Title : Molecular Genotyping of the ABO Blood Types Introduction 1. ABO 혈액형 ABO 유전자는 9번 염색체 장완(9p34)에 위치하며 모두 7개의 exon을 가지고 .. -
how_to_analyse_raw_DNA_and_protein_data
how to analyse raw DNA and protein data 1. this site is very useful to analyse your DNA and protein data(national center for Biotechnology information) @Welcome to NCBI 1) what's new 1996년도에서 19.. -
실험보고서 - 해양 미생물 DNA를 이용한 PCR 전기영동 실험
1. Introduction 1)PCR PCR 이란 DNA의 원하는 부분 (target sequence)을 증폭하는 방법이다. denaturation, annealing, extension 3가지 과정으로 구성되어 있고 이 과정이(circle) 반복 되면서 DNA가 증폭된다. ..
